大运河国家文化公园作为国家公园的新发展形式，其管理体制的合理性直接影响着大运河国家文化公园建设的效率。虽然大运河国家文化公园在管理体制方面尚无成熟案例，但中国国家公园提出的统一事权、分级管理体制和社区协调发展制度以及国外所采取的垂直管理体制、特许经营机制和公众参与机制都可为探索大运河国家文化公园管理与运营机制提供有益经验。未来，中国大运河国家文化公园可采取以政府为主导的垂直管理体制，同时完善社区共管机制和公众参与机制，构建新型管理体制。