公共卫生事关人民群众生命安全和身体健康，事关我国经济社会发展大局。2020年新冠肺炎疫情不仅检验了公共卫生体系的能力，更显示了部门协同、上下协同、区域协同的重要性。长三角地区公共卫生体系在新冠肺炎疫情中经受住了考验，发挥了重要作用。但是与重大疫情的威胁和挑战相比，当前长三角地区公共卫生体系还存在以下短板：一是区域内公共卫生基础能力不均衡，二是突发公共卫生事件发生时存在各自为战的情况，三是公共卫生信息系统尚未互联互通，四是疾控部门在应急治理中的核心能力有待提升，五是非常态状况下制度化的协同机制还不完善。为此，本报告提出如下建议：一要率先树立大公共卫生的理念并明确其公益性导向，二要提升疾控部门的核心能力，三要消除区域间的政策障碍实现协同共治，四要建立融合性的公共卫生服务大数据系统，五要充分发挥科学技术对于公共卫生风险防控的支撑作用，六要打造长三角高端公共卫生人才储备基地。