乡村振兴战略的实施离不开农村人力资本积累，农业全要素生产率的提高更离不开农村人力资本水平的提升。运用DEA-Malmquist测算珠江—西江经济带的农业全要素生产率，分别对其和人力资本现状进行分析。在作用机理上，农村教育人力资本通过提升区域创新能力、推动产业结构优化升级来提高农业全要素生产率，农村健康人力资本通过提高个人劳动参与率、改变消费偏好来提高农业全要素生产率。运用Tobit模型进行回归分析，发现农村教育人力资本和农村健康人力资本均对珠江—西江经济带的农业全要素生产率具有正向推动作用。据此，从促进教育机制变革，建立合理的教育评价体系，优化卫生资源的分配，改善农村地区的卫生服务水平等方面提出对策建议。