采用超效率DEA模型分别对不考虑非期望产出和考虑非期望产出两种情形下国家级新区产业创新效率进行测度，并进一步利用面板Tobit回归模型对产业创新效率影响因素进行探究。研究结果表明：两种情形下国家级新区产业创新效率呈现同步变动、逐年下降态势；中西部地区后成立的新区产业创新效率较高，而前期成立的东部经济发达地区新区产业创新效率较低；政府支持和金融服务对我国新区产业创新效率具有显著正向影响。在实证研究结论的基础上，借鉴其他国家级新区发展经验，对雄安新区产业发展提出针对性对策建议。